36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1557 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  55.88 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  55.88 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  55.88 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  55.4 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  53.9 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  55.56 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  46.81 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  43.07 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  44.03 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  31.71 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  34.17 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  27.91 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  30.5 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  32.23 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.71 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  25.37 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  25.19 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  28.23 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.65 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  24.41 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  26.83 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  25.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30.16 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  28.1 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  29.84 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>