49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4431 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  36.75 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.33 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  35.46 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.55 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.14 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  32.9 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  34.01 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  31.5 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.12 
 
 
358 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  31.52 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  25.58 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  34.68 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  24.56 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  30.91 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  33.56 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  35.16 
 
 
138 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  31.43 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  30.22 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  29.69 
 
 
185 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  34.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  27.61 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  28 
 
 
143 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  25 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  29.93 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  28.19 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  27.88 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  29.29 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.8 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28 
 
 
450 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  27.86 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  26.36 
 
 
150 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  26.45 
 
 
166 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  29.01 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  25.74 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  30.87 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>