27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6884 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  57.29 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  46.11 
 
 
209 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  41.36 
 
 
206 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  38.62 
 
 
208 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  32.82 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.58 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  32.79 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  26.52 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  25.74 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  32.23 
 
 
137 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  27.81 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  29.37 
 
 
358 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  29.08 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  28.89 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  23.57 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  28.19 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  28.06 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  30.51 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  27.63 
 
 
170 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  31.47 
 
 
155 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.37 
 
 
156 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  27.27 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>