37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2029 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  338  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  34.44 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  32.82 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  32.14 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  33.99 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  31.61 
 
 
208 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  31.11 
 
 
190 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  25.93 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  23.23 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32.23 
 
 
358 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  29.71 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.08 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.91 
 
 
138 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.29 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  32.95 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  29.93 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.71 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  28.26 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  27.85 
 
 
187 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.01 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2805  hypothetical protein  26.42 
 
 
243 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00093788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  32.67 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  27.54 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  28.36 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  28.03 
 
 
146 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  30.07 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  26.57 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  29.32 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  26.06 
 
 
190 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  25.33 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  28.37 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  33.68 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3810  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.258605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>