29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0292 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  57.29 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  45.98 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  44.89 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  42.94 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  35.77 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  33.57 
 
 		 159 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  31.11 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  29.92 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  28.67 
 
 		 358 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.22 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  27.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  22.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  30.56 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  28.03 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  28.03 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.14 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.61 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  29.79 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  30.66 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  26.12 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  24.64 
 
 		 150 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  36.07 
 
 		 138 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>