29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2604 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3065  hypothetical protein  35.97 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354628  normal  0.0341829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3773  hypothetical protein  32.64 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3020  hypothetical protein  31.71 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3746  hypothetical protein  31.71 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.258605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4128  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00815835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2296  hypothetical protein  30.47 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.168074  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  26.15 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  30.99 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  33.08 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  29.32 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  30.88 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  31.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  31.54 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6350  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0604522  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0326  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  32.31 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  26.77 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  34.33 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>