43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2721 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  38.28 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3727  hypothetical protein  34.09 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  32.52 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  29.69 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  32.52 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  29.69 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  32.52 
 
 
155 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  24.14 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.79 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  34.68 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  27.97 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  32.2 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  33.62 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  28.91 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.71 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  28.1 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.69 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  26.92 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  28.93 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  32.79 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.15 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  32.8 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  28.8 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  30.47 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  28.33 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  27.5 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  30.25 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.26 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  36.45 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.89 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0825  hypothetical protein  29.55 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.149035  unclonable  0.00000927167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.82 
 
 
190 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>