16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2450 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  100 
 
 
222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  32.98 
 
 
201 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00370  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.316399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  30.08 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09274  pathogenesis associated protein Pep2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14810)  25.77 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  30.18 
 
 
358 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  23.61 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  28.89 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  27.86 
 
 
178 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.15 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  29.21 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>