15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0745 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  47.16 
 
 		 172 aa  170  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  47.67 
 
 		 170 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  47.47 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  45.68 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  48.1 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  47.44 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  46.84 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  45.57 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  41.72 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  43.84 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  36.56 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  35.33 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>