13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3701 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  41.54 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  41.54 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  42.52 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  27.5 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  27.5 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  27.5 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  30.58 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>