15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4660 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4141  hydroxylacyl-CoA dehydrogenase  29.32 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.81248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  33.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2764  hypothetical protein  37.19 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00157353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2372  hypothetical protein  31.78 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.4 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4104  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  35.92 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0825  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.149035  unclonable  0.00000927167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  30.65 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.08 
 
 		 166 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  28 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1101  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  23.78 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.699365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4136  hypothetical protein  29.46 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.536365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>