More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1294 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1294  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  611  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1820  glycosyl transferase family protein  65.49 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1785  glycosyl transferase family protein  65.49 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  43.53 
 
 		 918 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  42.11 
 
 		 916 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.21 
 
 		 942 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  41.58 
 
 		 765 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.15 
 
 		 812 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  42.56 
 
 		 807 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.08 
 
 		 641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.62 
 
 		 643 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 		 797 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 807 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 773 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  33.98 
 
 		 642 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.23 
 
 		 905 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  36.63 
 
 		 807 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.41 
 
 		 640 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.43 
 
 		 841 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  30.57 
 
 		 850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.13 
 
 		 642 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 640 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0395  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 940 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119849 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.43 
 
 		 645 aa  125  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.65 
 
 		 618 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.73 
 
 		 770 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 		 625 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  35.57 
 
 		 812 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  34.23 
 
 		 638 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  37.76 
 
 		 818 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.19 
 
 		 643 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 818 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.19 
 
 		 643 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 		 648 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.89 
 
 		 751 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 679 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 829 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  37.38 
 
 		 807 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1213  glycosyl transferase family 51  30.99 
 
 		 985 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.47 
 
 		 680 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  35.06 
 
 		 680 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 680 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.41 
 
 		 817 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 680 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  32.48 
 
 		 827 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 667 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 673 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  31.23 
 
 		 793 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3484  penicillin-binding protein, 1A family  38.86 
 
 		 942 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0146326  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  30.74 
 
 		 794 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  30.74 
 
 		 794 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  31.47 
 
 		 680 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  31.23 
 
 		 793 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 673 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  34.63 
 
 		 680 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.7 
 
 		 771 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  28.73 
 
 		 851 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.29 
 
 		 683 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.58 
 
 		 823 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.95 
 
 		 795 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  32.84 
 
 		 820 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.58 
 
 		 823 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 		 796 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  31.62 
 
 		 679 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  30.91 
 
 		 839 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 		 830 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  38.5 
 
 		 778 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  28.36 
 
 		 851 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  28.73 
 
 		 852 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  31.82 
 
 		 832 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 914 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  33.09 
 
 		 802 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  32.82 
 
 		 819 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 		 848 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.81 
 
 		 655 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 880 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 654 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 796 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.84 
 
 		 814 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36 
 
 		 765 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 779 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  32.95 
 
 		 836 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 804 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  33.58 
 
 		 706 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  28.29 
 
 		 851 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  28.29 
 
 		 851 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  38.25 
 
 		 644 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  28.29 
 
 		 851 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3420  penicillin-binding protein, 1A family  38.82 
 
 		 920 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0447054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  31.82 
 
 		 830 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 803 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 		 796 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 750 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 833 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  28.36 
 
 		 851 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 		 757 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  32.82 
 
 		 819 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  33.08 
 
 		 819 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>