More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2157 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.010472  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2702  ABC oligo/dipeptide transporter, inner membrane subunit  90.09 
 
 
341 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.78 
 
 
341 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.01104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.51 
 
 
363 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.868873  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
369 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189691  hitchhiker  0.00140188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.26 
 
 
350 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.137235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 
345 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044169  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
337 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
319 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  33.03 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
317 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11732  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
317 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189193  normal  0.0388452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
324 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.33 
 
 
336 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
329 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
317 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
336 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654938  hitchhiker  0.00239439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
336 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
336 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
336 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  34.23 
 
 
336 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
336 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  34.23 
 
 
336 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
336 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0156  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.45 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383247  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  32.44 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  30.18 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0353588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  32.53 
 
 
324 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
306 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
321 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  31.48 
 
 
338 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
321 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0250  peptide ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
318 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  32.13 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.13 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
328 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5402  Nickel-transporting ATPase  29.63 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997864  hitchhiker  0.00986644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.42 
 
 
336 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  31.64 
 
 
336 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  30.03 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
317 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
334 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
304 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.440678 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
334 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.31 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  25.23 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  30.1 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  30.65 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
336 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  30.65 
 
 
339 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
319 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
306 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
336 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
323 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
318 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  28.4 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.725204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
336 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000749118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
309 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2568  ABC transporter permease  31.19 
 
 
328 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  0.256762 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
319 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
321 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 
319 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
345 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>