More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0195 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
345 aa  682    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.94 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.33 
 
 
345 aa  502  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000046996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.33 
 
 
345 aa  502  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000706294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.38 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.242543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 
343 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
341 aa  296  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
333 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
332 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
347 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.44 
 
 
336 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
334 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
334 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.18 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
318 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
321 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
321 aa  212  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  37.93 
 
 
318 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
321 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
336 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
334 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
318 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  37.32 
 
 
336 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
336 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  38.51 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.51 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
335 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
347 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000400167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
336 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 
337 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.18 
 
 
333 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.61 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
336 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.19 
 
 
359 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
339 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
318 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
338 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  37.03 
 
 
336 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
338 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
336 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36.42 
 
 
336 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  38.48 
 
 
336 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  38.66 
 
 
334 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
336 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  35.47 
 
 
336 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  37.9 
 
 
336 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
326 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
307 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
336 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
319 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 
337 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
356 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.57 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.21 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  37.61 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  37.25 
 
 
305 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
383 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
358 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
321 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.92 
 
 
337 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
321 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
352 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.54 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.21 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  36.81 
 
 
341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  38.14 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  36.05 
 
 
337 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.63 
 
 
339 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
321 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.63 
 
 
339 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  35.57 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>