More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2123 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
340 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
341 aa  295  5e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
345 aa  295  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
343 aa  289  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
345 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000706294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
345 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000046996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.47 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
345 aa  269  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.242543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.41 
 
 
339 aa  228  9e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.23 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.23 
 
 
336 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.94 
 
 
336 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
334 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.68 
 
 
336 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
336 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
361 aa  215  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  39.65 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 
333 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.97 
 
 
336 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
326 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
336 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.61 
 
 
337 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
328 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
347 aa  209  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000400167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  37.43 
 
 
336 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  37.8 
 
 
335 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
334 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
306 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
334 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  38.89 
 
 
334 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.84 
 
 
336 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
334 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
347 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
335 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
327 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
336 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 
335 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
335 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
337 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
335 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  37.75 
 
 
335 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
333 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
335 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  37.72 
 
 
336 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
364 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
336 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
345 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
334 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0563  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  36.18 
 
 
325 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  41.18 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  40.85 
 
 
340 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  37.43 
 
 
336 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
336 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
336 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
313 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
335 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  36.36 
 
 
327 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
324 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.781235  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
335 aa  202  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.84 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
338 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
338 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.82 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  35.73 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  34.32 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
334 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
319 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  40.85 
 
 
340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  36.76 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  36.66 
 
 
334 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  35.94 
 
 
339 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  34.31 
 
 
336 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  35.94 
 
 
339 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  35.94 
 
 
339 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  35.94 
 
 
339 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
334 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
332 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
334 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057278  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>