More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0217 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 334 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.61 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057278  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.07 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.26 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.87 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.61 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.08 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  61.86 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.16 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  60.42 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.42 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  60.48 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.65 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  48.65 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  47.75 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 		 333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  48.05 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.87 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  47.9 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  47.15 
 
 		 336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  47.15 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.15 
 
 		 336 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  46.85 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  47.75 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  45.18 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.15 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  47.15 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.75 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  47.46 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  47.75 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.27 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  48.35 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  48.35 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  48.35 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.15 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.15 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.27 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  48.05 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.27 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.87 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  45.56 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  45.56 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.87 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  47.75 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.87 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.45 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  47.45 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.87 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  45.56 
 
 		 351 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  45.27 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  45.27 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  45.65 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  45.65 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.58 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  44.38 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  45.65 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  43.79 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  43.2 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  43.49 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  47.46 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  46.85 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  44.74 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.02 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 		 346 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>