128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1527 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 147 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  74.83 
 
 		 153 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  49.58 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  49.58 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  47.46 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.4 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.41 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  43.43 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.94 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  37.5 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  36.96 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.2 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  39.52 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  35.59 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.35 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  33.91 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.67 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.67 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  36.22 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  29.84 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  30.83 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  32.56 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  35.71 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  29.75 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  30.47 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.75 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  35.29 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  29.03 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  34.71 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.27 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.34 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  32.2 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  34.29 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  38.55 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  31.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  28.8 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  34.31 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  28.32 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  34.94 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  35.92 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  30.91 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  28.89 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  29.66 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  32.69 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  32.79 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  31.68 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  37.65 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  33.05 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.63 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  32.38 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  35.45 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  32.73 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.68 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  29.79 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  34.26 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 476 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  34.65 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  37.61 
 
 		 139 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  29.79 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  34.12 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>