More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5616 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5616  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 329 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0588  hypothetical protein  63.86 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  50.93 
 
 		 323 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.78 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.51 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.56 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.98 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.25 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.16 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.2 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.96 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.98 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.45 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.09 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.05 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.91 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.45 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.79 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.79 
 
 		 353 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.71 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.79 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  36.03 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.82 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.79 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  37.75 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.82 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.93 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  35.37 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.1 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  37.21 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  32.32 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  35.56 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.79 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  33.54 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.25 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.46 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.06 
 
 		 343 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  34.98 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  39.59 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.3 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.41 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.22 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  35.12 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.02 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.95 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  36.3 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  35.26 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  36.18 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  32.83 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.06 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  35.47 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  38.11 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.64 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.14 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.64 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  32.42 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  37 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.16 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.23 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  36.34 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  34.88 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  34.9 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.45 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.21 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  34.33 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.12 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  34.77 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.94 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.21 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33.94 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.73 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  37.8 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.34 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  35.9 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  32.55 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.12 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.99 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  34.5 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.31 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.13 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.55 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  32.93 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5007  hypothetical protein  35.62 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.85 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>