229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4016 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 586 aa  1146    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  77.72 
 
 		 599 aa  841    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  95.73 
 
 		 588 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  90.8 
 
 		 590 aa  969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  55.28 
 
 		 580 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  52.45 
 
 		 605 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  53.09 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  51.22 
 
 		 614 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  51.19 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  50.17 
 
 		 566 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  45.42 
 
 		 563 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  47.2 
 
 		 573 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  45.1 
 
 		 546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.48 
 
 		 621 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  44.5 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.67 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  42.67 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.33 
 
 		 618 aa  290  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.97 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.18 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.98 
 
 		 618 aa  280  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.07 
 
 		 618 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.21 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.81 
 
 		 608 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.37 
 
 		 636 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  55.51 
 
 		 625 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  57.87 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.45 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.4 
 
 		 671 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.98 
 
 		 701 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.35 
 
 		 711 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.21 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.48 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.52 
 
 		 703 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.58 
 
 		 677 aa  193  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.25 
 
 		 721 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  31.24 
 
 		 617 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.19 
 
 		 668 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.83 
 
 		 619 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  28.33 
 
 		 683 aa  167  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.17 
 
 		 688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.8 
 
 		 643 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  30.43 
 
 		 650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  34.38 
 
 		 637 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  28.73 
 
 		 669 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.19 
 
 		 680 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  29.86 
 
 		 653 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.65 
 
 		 674 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.3 
 
 		 665 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.05 
 
 		 672 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  28.82 
 
 		 654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.01 
 
 		 673 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.01 
 
 		 673 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  28.83 
 
 		 696 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  29.6 
 
 		 614 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.3 
 
 		 678 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.29 
 
 		 664 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  29.53 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  29.76 
 
 		 670 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.78 
 
 		 717 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.78 
 
 		 717 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39 
 
 		 714 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  33.67 
 
 		 800 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  31.2 
 
 		 657 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.41 
 
 		 616 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  36.46 
 
 		 612 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  30.87 
 
 		 719 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 699 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.78 
 
 		 622 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.78 
 
 		 622 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.78 
 
 		 622 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  32.47 
 
 		 618 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  29.21 
 
 		 626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.31 
 
 		 653 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  29.95 
 
 		 638 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  39.57 
 
 		 705 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29 
 
 		 673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  40.5 
 
 		 674 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  33.68 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  35.4 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  40.74 
 
 		 329 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  38.89 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  36.68 
 
 		 265 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  43.33 
 
 		 680 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  34.13 
 
 		 689 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  38.92 
 
 		 719 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.52 
 
 		 788 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  39.88 
 
 		 776 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  42.01 
 
 		 690 aa  94  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  48.8 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  32.78 
 
 		 333 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  32.85 
 
 		 340 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  44.3 
 
 		 754 aa  87  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  38.36 
 
 		 749 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  24.86 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  32.49 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  32.49 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.13 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.63 
 
 		 335 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 272 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>