More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2084 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  100 
 
 
617 aa  1248    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  45.27 
 
 
612 aa  478  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  38.51 
 
 
650 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  38.12 
 
 
653 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  37.23 
 
 
660 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  38.08 
 
 
670 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  36.02 
 
 
689 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.68 
 
 
688 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  32.63 
 
 
669 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.25 
 
 
680 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  33.19 
 
 
696 aa  296  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.88 
 
 
671 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.24 
 
 
653 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  31.26 
 
 
643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.86 
 
 
619 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.69 
 
 
618 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.96 
 
 
621 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  33.07 
 
 
614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.34 
 
 
619 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.48 
 
 
677 aa  274  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.49 
 
 
665 aa  272  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.11 
 
 
664 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.07 
 
 
618 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.55 
 
 
618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.34 
 
 
620 aa  269  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.91 
 
 
619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.71 
 
 
616 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.44 
 
 
668 aa  268  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  34.84 
 
 
719 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.92 
 
 
701 aa  264  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.65 
 
 
725 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.69 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.69 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.69 
 
 
622 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  33.67 
 
 
657 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  32.57 
 
 
705 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  31.78 
 
 
637 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  34.02 
 
 
626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  33.83 
 
 
674 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  33.49 
 
 
629 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.8 
 
 
674 aa  252  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.02 
 
 
711 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.68 
 
 
727 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  33.64 
 
 
638 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  33.91 
 
 
618 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.02 
 
 
721 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  31.59 
 
 
699 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.83 
 
 
673 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  29.82 
 
 
654 aa  226  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  33.55 
 
 
680 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.2 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.71 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  29.26 
 
 
719 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  27.42 
 
 
594 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  32.57 
 
 
580 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  37.23 
 
 
329 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  37.55 
 
 
309 aa  175  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  30.59 
 
 
599 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  45.14 
 
 
713 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.01 
 
 
384 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.09 
 
 
383 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  32.37 
 
 
382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  35.35 
 
 
333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  36.96 
 
 
337 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  36.96 
 
 
337 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  44.98 
 
 
265 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.31 
 
 
362 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.65 
 
 
335 aa  163  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  35.77 
 
 
340 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.96 
 
 
333 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.41 
 
 
386 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.23 
 
 
383 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  34.59 
 
 
342 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  31.61 
 
 
346 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  31.66 
 
 
337 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.31 
 
 
362 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.31 
 
 
362 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.62 
 
 
358 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  34.62 
 
 
358 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.35 
 
 
362 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.35 
 
 
362 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  43.43 
 
 
738 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  43.03 
 
 
730 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  36.28 
 
 
342 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.19 
 
 
374 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  31.7 
 
 
588 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  36.71 
 
 
344 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  31.44 
 
 
586 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  30.55 
 
 
346 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  31.03 
 
 
590 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.35 
 
 
362 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.55 
 
 
369 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.97 
 
 
600 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.19 
 
 
373 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.63 
 
 
362 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  31.65 
 
 
351 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.77 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  30.97 
 
 
356 aa  154  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  39.21 
 
 
358 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.77 
 
 
391 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>