210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1621 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 625 aa  1216    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  51.81 
 
 		 605 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  49.6 
 
 		 599 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  50.41 
 
 		 590 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  51.05 
 
 		 586 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  52.72 
 
 		 580 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  50.16 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  50.57 
 
 		 582 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  48.91 
 
 		 614 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  49.08 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  44.7 
 
 		 563 aa  364  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  49.26 
 
 		 566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  43.26 
 
 		 573 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  44.26 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  44.26 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.43 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.65 
 
 		 619 aa  275  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.7 
 
 		 620 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.02 
 
 		 618 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.59 
 
 		 618 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.75 
 
 		 619 aa  261  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.33 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.79 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.68 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  61.51 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.77 
 
 		 701 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.4 
 
 		 703 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.72 
 
 		 677 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.4 
 
 		 671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.8 
 
 		 725 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.86 
 
 		 727 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.95 
 
 		 664 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.03 
 
 		 711 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.23 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.02 
 
 		 721 aa  200  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.67 
 
 		 619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.85 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.51 
 
 		 680 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  32.31 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  29.47 
 
 		 617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  29.3 
 
 		 683 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  40.13 
 
 		 717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  42.25 
 
 		 636 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  28.9 
 
 		 669 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39.81 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  27.24 
 
 		 614 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.87 
 
 		 665 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  23.89 
 
 		 643 aa  157  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.63 
 
 		 672 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  41.78 
 
 		 714 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36 
 
 		 678 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.57 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.57 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  28.55 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  29.19 
 
 		 653 aa  148  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.79 
 
 		 668 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  29.49 
 
 		 612 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.76 
 
 		 653 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  28.62 
 
 		 696 aa  141  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.84 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.76 
 
 		 699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  30.29 
 
 		 719 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  40.33 
 
 		 660 aa  130  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  33.99 
 
 		 654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  28.77 
 
 		 657 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  29.24 
 
 		 705 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  28.77 
 
 		 618 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.9 
 
 		 622 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.9 
 
 		 622 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.9 
 
 		 622 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  38.94 
 
 		 689 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.62 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  36.16 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  38.03 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  37.62 
 
 		 265 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  28.52 
 
 		 638 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  22.64 
 
 		 594 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  45.81 
 
 		 546 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  38.98 
 
 		 738 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  42.46 
 
 		 674 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  43.29 
 
 		 680 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  43.48 
 
 		 719 aa  94.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.07 
 
 		 616 aa  94  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  34.78 
 
 		 713 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  39.43 
 
 		 749 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  41.67 
 
 		 776 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  42.33 
 
 		 690 aa  87.4  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.86 
 
 		 788 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  31.32 
 
 		 340 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  30.88 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  36.87 
 
 		 754 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  38.99 
 
 		 607 aa  82.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  31.15 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  31.15 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  40.14 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 272 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  36.51 
 
 		 637 aa  78.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.49 
 
 		 335 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  24.74 
 
 		 309 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>