More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0236 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  66.3 
 
 
727 aa  896    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  100 
 
 
703 aa  1399    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  89.9 
 
 
701 aa  1180    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  65.98 
 
 
725 aa  906    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  64.05 
 
 
677 aa  821    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  74.86 
 
 
690 aa  985    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  65.51 
 
 
721 aa  873    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  58.05 
 
 
671 aa  787    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.04 
 
 
711 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  51.88 
 
 
683 aa  651    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  88.29 
 
 
717 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  88.63 
 
 
717 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  87.89 
 
 
714 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  71.09 
 
 
678 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  70.69 
 
 
672 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  71.38 
 
 
673 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  71.38 
 
 
673 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  68.33 
 
 
668 aa  425  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  71.04 
 
 
664 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.04 
 
 
688 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.08 
 
 
618 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.57 
 
 
621 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.6 
 
 
619 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.71 
 
 
620 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.27 
 
 
618 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  35.88 
 
 
669 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.12 
 
 
618 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.26 
 
 
619 aa  355  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.57 
 
 
680 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  55.41 
 
 
800 aa  336  7.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  35.45 
 
 
660 aa  333  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  34.95 
 
 
650 aa  333  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.7 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  36.94 
 
 
637 aa  326  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  34.37 
 
 
696 aa  323  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  33.91 
 
 
614 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  34.95 
 
 
653 aa  320  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.94 
 
 
610 aa  319  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  33.71 
 
 
689 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  34.92 
 
 
670 aa  306  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.28 
 
 
665 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.95 
 
 
705 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  34.94 
 
 
617 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  34.43 
 
 
657 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  35.1 
 
 
719 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.48 
 
 
619 aa  257  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.38 
 
 
622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.38 
 
 
622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.38 
 
 
622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
699 aa  251  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  34.36 
 
 
618 aa  250  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.77 
 
 
673 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  27.29 
 
 
643 aa  235  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.08 
 
 
612 aa  230  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  38.62 
 
 
345 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  37.31 
 
 
356 aa  226  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  37.95 
 
 
347 aa  226  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.99 
 
 
383 aa  225  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.48 
 
 
653 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  38.04 
 
 
346 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  38.75 
 
 
637 aa  224  6e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.17 
 
 
337 aa  224  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  38.41 
 
 
364 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.32 
 
 
382 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  36.76 
 
 
351 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  38.44 
 
 
346 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  40 
 
 
369 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.63 
 
 
364 aa  221  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  31.44 
 
 
605 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.51 
 
 
616 aa  219  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  39.02 
 
 
443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.27 
 
 
383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  36.96 
 
 
364 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.81 
 
 
357 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.38 
 
 
362 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.38 
 
 
362 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.35 
 
 
386 aa  217  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.7 
 
 
340 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.77 
 
 
374 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.68 
 
 
341 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.77 
 
 
384 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.18 
 
 
362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  39.13 
 
 
372 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.35 
 
 
341 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  39.94 
 
 
654 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.96 
 
 
362 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.79 
 
 
362 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.64 
 
 
340 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.23 
 
 
391 aa  213  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.32 
 
 
362 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.54 
 
 
358 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.54 
 
 
358 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.55 
 
 
362 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.97 
 
 
337 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.46 
 
 
340 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.27 
 
 
373 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.99 
 
 
340 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  37.69 
 
 
337 aa  211  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.77 
 
 
362 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.77 
 
 
386 aa  210  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>