128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1021 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  90.29 
 
 		 564 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  90.11 
 
 		 558 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 546 aa  1041    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  56.2 
 
 		 563 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  55.76 
 
 		 573 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  45.28 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  45.26 
 
 		 588 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  43.57 
 
 		 580 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  42.86 
 
 		 599 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  43.46 
 
 		 590 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  44.13 
 
 		 605 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  45.81 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  46.65 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  41.77 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  43.58 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.41 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.04 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.54 
 
 		 621 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.93 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.82 
 
 		 620 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.65 
 
 		 618 aa  196  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.8 
 
 		 619 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.28 
 
 		 671 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.25 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.29 
 
 		 610 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.18 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.6 
 
 		 608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.51 
 
 		 725 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.87 
 
 		 727 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.87 
 
 		 711 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.48 
 
 		 677 aa  180  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  51.36 
 
 		 581 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.1 
 
 		 690 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.72 
 
 		 703 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.58 
 
 		 721 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.13 
 
 		 672 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.28 
 
 		 636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.62 
 
 		 678 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.98 
 
 		 717 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.03 
 
 		 668 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.98 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  30.26 
 
 		 617 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  40.07 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.49 
 
 		 673 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.49 
 
 		 673 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  29.91 
 
 		 669 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.71 
 
 		 680 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  27.6 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  30.09 
 
 		 637 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  31.53 
 
 		 800 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.51 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  37.01 
 
 		 654 aa  126  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.28 
 
 		 665 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  28.4 
 
 		 612 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  26.58 
 
 		 650 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  26.17 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  26.83 
 
 		 653 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  26.94 
 
 		 619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  42.19 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  27.97 
 
 		 670 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.93 
 
 		 674 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  38.4 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  36.75 
 
 		 265 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  33.07 
 
 		 657 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  37.11 
 
 		 329 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.53 
 
 		 622 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.53 
 
 		 622 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.53 
 
 		 622 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.61 
 
 		 616 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.71 
 
 		 653 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  38.26 
 
 		 719 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  37.02 
 
 		 643 aa  97.1  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  35.56 
 
 		 696 aa  94.7  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  44.85 
 
 		 738 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  24.42 
 
 		 689 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  38.96 
 
 		 730 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  31.82 
 
 		 618 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  41 
 
 		 713 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  31.55 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  46.2 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.74 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  43.92 
 
 		 754 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  44.53 
 
 		 629 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  40.99 
 
 		 776 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  35.86 
 
 		 719 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.9 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 		 749 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  45 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  31.9 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  31.28 
 
 		 637 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.11 
 
 		 600 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  31.15 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  40.16 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0107  magnesium chelatase  34.65 
 
 		 178 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0353838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.39 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  32.02 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  25.64 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>