More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50740 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.07 
 
 
677 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  52.27 
 
 
671 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  100 
 
 
800 aa  1626    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  49.35 
 
 
683 aa  611  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  48.08 
 
 
690 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  49.38 
 
 
703 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  46.7 
 
 
725 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  47.05 
 
 
711 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  46.64 
 
 
727 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  46.22 
 
 
721 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.99 
 
 
688 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  55.52 
 
 
668 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.36 
 
 
672 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.06 
 
 
678 aa  343  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  34.08 
 
 
669 aa  341  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  54.98 
 
 
664 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.07 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  55.34 
 
 
673 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  55.34 
 
 
673 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.91 
 
 
619 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.2 
 
 
618 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  54.29 
 
 
717 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.92 
 
 
701 aa  331  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.55 
 
 
618 aa  330  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  53.97 
 
 
717 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.32 
 
 
680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.91 
 
 
618 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.64 
 
 
620 aa  324  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  34.87 
 
 
660 aa  324  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.91 
 
 
619 aa  316  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  53.8 
 
 
714 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  35.23 
 
 
637 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  32.92 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  32.78 
 
 
653 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  31.61 
 
 
689 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  33.15 
 
 
670 aa  289  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.9 
 
 
665 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  32.05 
 
 
650 aa  279  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  30.76 
 
 
614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.29 
 
 
610 aa  248  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.89 
 
 
608 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  33.07 
 
 
657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.88 
 
 
719 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  32.37 
 
 
618 aa  230  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  26.69 
 
 
643 aa  227  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  29.25 
 
 
617 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.22 
 
 
622 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.22 
 
 
622 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.22 
 
 
622 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  29.97 
 
 
699 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.22 
 
 
619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  31.2 
 
 
612 aa  221  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.55 
 
 
600 aa  220  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  38.6 
 
 
364 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.53 
 
 
673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  38.3 
 
 
364 aa  208  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.24 
 
 
384 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.84 
 
 
386 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  36.23 
 
 
356 aa  204  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  36.45 
 
 
372 aa  204  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.63 
 
 
383 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  40.82 
 
 
654 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.02 
 
 
653 aa  200  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.66 
 
 
616 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  36.09 
 
 
346 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  34.46 
 
 
637 aa  197  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  33.84 
 
 
356 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  34.05 
 
 
637 aa  196  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.09 
 
 
337 aa  196  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  36.64 
 
 
362 aa  195  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.95 
 
 
358 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.95 
 
 
358 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  29.97 
 
 
605 aa  195  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.54 
 
 
386 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.79 
 
 
383 aa  194  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  37.76 
 
 
362 aa  194  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.37 
 
 
362 aa  194  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.8 
 
 
374 aa  194  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  37.19 
 
 
362 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  37.19 
 
 
362 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.68 
 
 
391 aa  193  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.31 
 
 
369 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.23 
 
 
382 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.75 
 
 
373 aa  191  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  36.99 
 
 
362 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.65 
 
 
364 aa  190  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.07 
 
 
788 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  35.22 
 
 
365 aa  187  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.38 
 
 
340 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.76 
 
 
337 aa  187  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  35.99 
 
 
443 aa  187  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  35.93 
 
 
362 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  35.37 
 
 
346 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  35.14 
 
 
345 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.08 
 
 
357 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.42 
 
 
405 aa  185  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.19 
 
 
362 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.53 
 
 
337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  35.45 
 
 
337 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.28 
 
 
370 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>