266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2540 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  90.46 
 
 		 610 aa  942    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  100 
 
 		 608 aa  1176    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  56.94 
 
 		 636 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.57 
 
 		 621 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  46.59 
 
 		 618 aa  502  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.75 
 
 		 620 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.22 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.95 
 
 		 619 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  46.92 
 
 		 618 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.31 
 
 		 619 aa  482  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.02 
 
 		 701 aa  363  6e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.05 
 
 		 664 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.73 
 
 		 671 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.36 
 
 		 677 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.97 
 
 		 668 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.42 
 
 		 703 aa  350  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.84 
 
 		 725 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39.73 
 
 		 717 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39.38 
 
 		 717 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.88 
 
 		 727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.86 
 
 		 690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.74 
 
 		 711 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  35.08 
 
 		 683 aa  333  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.29 
 
 		 721 aa  333  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.23 
 
 		 714 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  38.57 
 
 		 580 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.88 
 
 		 688 aa  274  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  34.5 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.65 
 
 		 680 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  32.64 
 
 		 669 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  34.75 
 
 		 617 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  40.49 
 
 		 605 aa  263  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  33.76 
 
 		 614 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  35.94 
 
 		 637 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  33.43 
 
 		 660 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  33.59 
 
 		 653 aa  249  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  27.51 
 
 		 643 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  38.1 
 
 		 590 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.79 
 
 		 619 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  36.64 
 
 		 599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  37.27 
 
 		 586 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.08 
 
 		 674 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  38.22 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  31.86 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.88 
 
 		 653 aa  228  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  34.33 
 
 		 670 aa  226  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.94 
 
 		 616 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.33 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  37.37 
 
 		 588 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.33 
 
 		 622 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.33 
 
 		 622 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.33 
 
 		 622 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  36.98 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  32.19 
 
 		 626 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.21 
 
 		 665 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  33.94 
 
 		 674 aa  207  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.77 
 
 		 673 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.04 
 
 		 612 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  35.45 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  33.6 
 
 		 618 aa  199  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  32.3 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  33.51 
 
 		 629 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.03 
 
 		 672 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.19 
 
 		 678 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  34.62 
 
 		 719 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  44.03 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  44.03 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.26 
 
 		 674 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 		 699 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  38.57 
 
 		 566 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  28.57 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  35.51 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  34.73 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  37.13 
 
 		 333 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  38.62 
 
 		 340 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  38.13 
 
 		 800 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.31 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.1 
 
 		 600 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  38.49 
 
 		 337 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  38.49 
 
 		 337 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  36.94 
 
 		 342 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.54 
 
 		 333 aa  164  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  32.4 
 
 		 309 aa  161  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.89 
 
 		 335 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  49.37 
 
 		 581 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  43.25 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  38.27 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  35.09 
 
 		 654 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  45.53 
 
 		 564 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  45.53 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  35.02 
 
 		 372 aa  150  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  42.57 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.56 
 
 		 351 aa  146  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.79 
 
 		 364 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  33.12 
 
 		 346 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  32.91 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  33.12 
 
 		 637 aa  144  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  31.76 
 
 		 346 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  35.45 
 
 		 342 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>