262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0498 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  100 
 
 
612 aa  1223    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  45.37 
 
 
617 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  38.36 
 
 
650 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  38.55 
 
 
653 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.32 
 
 
688 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  38.76 
 
 
670 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  36.42 
 
 
689 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  37.78 
 
 
660 aa  352  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  33.79 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.55 
 
 
680 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  32.42 
 
 
696 aa  293  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.48 
 
 
619 aa  266  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.34 
 
 
653 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  33.08 
 
 
637 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  31.2 
 
 
614 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.42 
 
 
671 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  32.67 
 
 
705 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  27.97 
 
 
643 aa  243  9e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.41 
 
 
621 aa  243  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.39 
 
 
622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.39 
 
 
622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.39 
 
 
622 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  34.1 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.1 
 
 
616 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  34.22 
 
 
674 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  34.98 
 
 
657 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.53 
 
 
665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  32.3 
 
 
638 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.29 
 
 
674 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.02 
 
 
618 aa  229  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.1 
 
 
618 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.77 
 
 
677 aa  220  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  32.61 
 
 
699 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  33.87 
 
 
618 aa  219  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.49 
 
 
719 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.01 
 
 
618 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.54 
 
 
620 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  31.57 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.91 
 
 
725 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.94 
 
 
619 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.14 
 
 
664 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  29.43 
 
 
683 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.4 
 
 
690 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.69 
 
 
727 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.9 
 
 
711 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.75 
 
 
678 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.49 
 
 
673 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.03 
 
 
721 aa  195  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.65 
 
 
703 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  31.03 
 
 
654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  35.69 
 
 
314 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  40.13 
 
 
713 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  41.14 
 
 
738 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.33 
 
 
608 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
329 aa  167  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  39.72 
 
 
340 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  40.07 
 
 
337 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  40.07 
 
 
337 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  27.05 
 
 
594 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  43.51 
 
 
730 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.44 
 
 
383 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  32.93 
 
 
607 aa  158  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  32.91 
 
 
384 aa  157  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  39.31 
 
 
333 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  34.58 
 
 
309 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.44 
 
 
391 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.59 
 
 
386 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.54 
 
 
383 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.42 
 
 
357 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  32.18 
 
 
382 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  40.31 
 
 
265 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  32.29 
 
 
347 aa  150  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.31 
 
 
335 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.76 
 
 
362 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.76 
 
 
362 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  32.26 
 
 
334 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.41 
 
 
337 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  32.19 
 
 
351 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.03 
 
 
369 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.86 
 
 
362 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  33.94 
 
 
365 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.08 
 
 
337 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.08 
 
 
337 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.13 
 
 
357 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  48.45 
 
 
690 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.35 
 
 
374 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  31.44 
 
 
345 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.13 
 
 
373 aa  143  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.66 
 
 
358 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.66 
 
 
358 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.5 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  34.64 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.5 
 
 
362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.5 
 
 
362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.7 
 
 
364 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  37.12 
 
 
358 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  29.87 
 
 
362 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  30.95 
 
 
580 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  32.02 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.7 
 
 
788 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>