216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0486 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 605 aa  1150    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  54.83 
 
 		 599 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  54.18 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  52.84 
 
 		 590 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  54.52 
 
 		 588 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  52.89 
 
 		 580 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  52.24 
 
 		 614 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  51.99 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  50.77 
 
 		 587 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  45.81 
 
 		 563 aa  332  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  49.24 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  44.65 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  44.88 
 
 		 573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  44.98 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.77 
 
 		 621 aa  269  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.44 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.72 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.96 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.66 
 
 		 619 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.39 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.06 
 
 		 620 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.9 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.79 
 
 		 608 aa  240  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.8 
 
 		 671 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  54.41 
 
 		 625 aa  221  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  37.94 
 
 		 564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  57.68 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.72 
 
 		 664 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.4 
 
 		 690 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.17 
 
 		 677 aa  211  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.51 
 
 		 725 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.18 
 
 		 711 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.02 
 
 		 727 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  31.43 
 
 		 683 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  31.19 
 
 		 637 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.42 
 
 		 643 aa  167  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  43.98 
 
 		 636 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  25.79 
 
 		 680 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  26.98 
 
 		 619 aa  160  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.17 
 
 		 688 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.59 
 
 		 672 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  28.21 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.72 
 
 		 678 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.37 
 
 		 673 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.37 
 
 		 673 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  29.62 
 
 		 617 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.43 
 
 		 668 aa  146  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  27.53 
 
 		 669 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.28 
 
 		 717 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.67 
 
 		 674 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.92 
 
 		 717 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.73 
 
 		 701 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  36 
 
 		 703 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.55 
 
 		 616 aa  140  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  35.14 
 
 		 721 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.76 
 
 		 714 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  28.28 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  34.58 
 
 		 800 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  28.78 
 
 		 653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.65 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.65 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.65 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 		 665 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  28.43 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  28.87 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  43.59 
 
 		 654 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  29.83 
 
 		 618 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  38.91 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  38.11 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  44.14 
 
 		 730 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  34.91 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  39.81 
 
 		 670 aa  101  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  42.13 
 
 		 674 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  49.62 
 
 		 629 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  36.44 
 
 		 265 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  33.61 
 
 		 689 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  45.12 
 
 		 749 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  41.57 
 
 		 690 aa  87.8  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  39.47 
 
 		 776 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  48.12 
 
 		 638 aa  87  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.86 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  39.56 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  33.33 
 
 		 719 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  47.37 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.09 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.27 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  47.69 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  27.74 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  28.31 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  40.59 
 
 		 607 aa  74.3  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  24.74 
 
 		 594 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  36.43 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  34.59 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  36.43 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.84 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.84 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  27.41 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  27.41 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  23.51 
 
 		 600 aa  67  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>