133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0274 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 564 aa  1066    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  99.28 
 
 		 558 aa  1049    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  89.93 
 
 		 546 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  55.54 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  54.69 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  46.33 
 
 		 580 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  44.58 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  44.73 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  42.4 
 
 		 599 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  43.72 
 
 		 590 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  42.53 
 
 		 605 aa  342  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  45.57 
 
 		 614 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  46.55 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  42.5 
 
 		 587 aa  267  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  44.28 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.52 
 
 		 618 aa  223  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.85 
 
 		 621 aa  220  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.9 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.28 
 
 		 618 aa  207  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.33 
 
 		 620 aa  206  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.6 
 
 		 618 aa  206  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.66 
 
 		 619 aa  200  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.35 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.1 
 
 		 664 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.73 
 
 		 677 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.71 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.94 
 
 		 725 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.7 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.93 
 
 		 690 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.5 
 
 		 608 aa  180  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.88 
 
 		 701 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  31.17 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  51.75 
 
 		 581 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.16 
 
 		 668 aa  169  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.22 
 
 		 672 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.79 
 
 		 636 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  40.42 
 
 		 714 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.65 
 
 		 721 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.54 
 
 		 703 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.95 
 
 		 678 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.64 
 
 		 717 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.64 
 
 		 717 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.77 
 
 		 673 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  30.55 
 
 		 617 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.77 
 
 		 673 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  30.78 
 
 		 669 aa  154  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  35.75 
 
 		 637 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  29.27 
 
 		 683 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  25.54 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  34.39 
 
 		 800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.85 
 
 		 660 aa  133  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.24 
 
 		 688 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  26.79 
 
 		 650 aa  130  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.24 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  28.8 
 
 		 612 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  37.4 
 
 		 654 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  44.98 
 
 		 625 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.38 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  25.41 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  33.25 
 
 		 699 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  27.01 
 
 		 653 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  27.73 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  35.5 
 
 		 657 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.21 
 
 		 674 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  33.15 
 
 		 670 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  39.46 
 
 		 705 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  37.61 
 
 		 265 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.98 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  31.38 
 
 		 719 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.08 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.08 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.08 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  38.67 
 
 		 329 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  37.36 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.21 
 
 		 616 aa  97.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  46.41 
 
 		 738 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  38.43 
 
 		 730 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  33.52 
 
 		 674 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.11 
 
 		 689 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.89 
 
 		 618 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  31.4 
 
 		 638 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  46.84 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  41 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.98 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  41.61 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  45.24 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.53 
 
 		 626 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.36 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  39.26 
 
 		 749 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  38.19 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  45.8 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  31.9 
 
 		 637 aa  74.7  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  31.28 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.33 
 
 		 600 aa  72  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  31.15 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  40.16 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0107  magnesium chelatase  34.65 
 
 		 178 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0353838  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  23.55 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.43 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>