More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  100 
 
 
714 aa  1422    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  76.43 
 
 
717 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.75 
 
 
678 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  79.57 
 
 
690 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.99 
 
 
727 aa  931    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  76.9 
 
 
703 aa  1016    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  78.99 
 
 
701 aa  1042    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  68.32 
 
 
725 aa  942    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  61.97 
 
 
677 aa  808    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  57.12 
 
 
673 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  56.42 
 
 
671 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  76.57 
 
 
717 aa  1064    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  65.73 
 
 
721 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  57.12 
 
 
673 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.33 
 
 
672 aa  745    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  48.79 
 
 
683 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  57.62 
 
 
668 aa  736    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  57.81 
 
 
664 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.56 
 
 
711 aa  924    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  38.76 
 
 
654 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.77 
 
 
688 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.69 
 
 
618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  34.95 
 
 
669 aa  352  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.53 
 
 
618 aa  351  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.86 
 
 
621 aa  350  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.27 
 
 
620 aa  350  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.75 
 
 
619 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.37 
 
 
618 aa  345  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  34.41 
 
 
680 aa  342  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.9 
 
 
619 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  53.8 
 
 
800 aa  329  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  35.87 
 
 
660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.71 
 
 
610 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  34.58 
 
 
696 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  40 
 
 
608 aa  314  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  35.01 
 
 
637 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  40 
 
 
636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  33.52 
 
 
653 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  33.43 
 
 
670 aa  290  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  34.41 
 
 
650 aa  289  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  32.73 
 
 
705 aa  287  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.87 
 
 
665 aa  280  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  30.7 
 
 
614 aa  276  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  33.71 
 
 
657 aa  270  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  33.84 
 
 
617 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.11 
 
 
674 aa  265  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  35.12 
 
 
719 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.65 
 
 
673 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  31.24 
 
 
699 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.24 
 
 
619 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  33.76 
 
 
618 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  35.11 
 
 
605 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.16 
 
 
622 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.16 
 
 
622 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.16 
 
 
622 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  38.97 
 
 
364 aa  228  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.24 
 
 
383 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.95 
 
 
383 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  39.31 
 
 
637 aa  221  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  39.6 
 
 
637 aa  221  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.84 
 
 
382 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  36.89 
 
 
346 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.71 
 
 
638 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.32 
 
 
616 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  36.35 
 
 
580 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  36.6 
 
 
345 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  37.85 
 
 
372 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.68 
 
 
340 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.96 
 
 
386 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  35.94 
 
 
346 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.65 
 
 
384 aa  212  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  35.26 
 
 
364 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  26.9 
 
 
643 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  35.36 
 
 
347 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  32.88 
 
 
599 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.96 
 
 
386 aa  210  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.54 
 
 
369 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  34.11 
 
 
356 aa  209  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.57 
 
 
337 aa  209  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  36.34 
 
 
443 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.59 
 
 
405 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.99 
 
 
391 aa  208  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.03 
 
 
340 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.05 
 
 
370 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.1 
 
 
373 aa  207  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.55 
 
 
374 aa  207  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.71 
 
 
340 aa  207  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  34.67 
 
 
351 aa  206  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.13 
 
 
600 aa  206  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.8 
 
 
653 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  37.16 
 
 
362 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  37.16 
 
 
362 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  36.86 
 
 
362 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.8 
 
 
341 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.71 
 
 
340 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.71 
 
 
357 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.71 
 
 
337 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  35.68 
 
 
614 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  37.88 
 
 
334 aa  203  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.42 
 
 
337 aa  203  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>