210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3198 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  100 
 
 		 614 aa  1137    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  78.96 
 
 		 582 aa  786    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  52.88 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  51.68 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  51.22 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  50 
 
 		 590 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  51.31 
 
 		 588 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  48.33 
 
 		 599 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  55.89 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  47.33 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  48.21 
 
 		 563 aa  351  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  49.35 
 
 		 573 aa  335  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  45.81 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.75 
 
 		 621 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.34 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.7 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.65 
 
 		 618 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.75 
 
 		 618 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.59 
 
 		 619 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.75 
 
 		 620 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.08 
 
 		 701 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.93 
 
 		 717 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.1 
 
 		 717 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.83 
 
 		 636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.21 
 
 		 725 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.32 
 
 		 727 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.27 
 
 		 711 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.61 
 
 		 690 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.76 
 
 		 671 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.71 
 
 		 714 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.56 
 
 		 664 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.03 
 
 		 721 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.1 
 
 		 703 aa  204  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.15 
 
 		 677 aa  198  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  42.82 
 
 		 608 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.34 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.01 
 
 		 668 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  30.24 
 
 		 683 aa  187  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.69 
 
 		 678 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.7 
 
 		 680 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.55 
 
 		 619 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  30.86 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.68 
 
 		 688 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  45.96 
 
 		 625 aa  174  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  33.28 
 
 		 637 aa  170  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  66.26 
 
 		 566 aa  157  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.98 
 
 		 672 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  31.79 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  29.24 
 
 		 617 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  43.44 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  43.44 
 
 		 673 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  30.32 
 
 		 650 aa  150  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  23.17 
 
 		 643 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  36.9 
 
 		 800 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.24 
 
 		 653 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  32.65 
 
 		 705 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  47.43 
 
 		 654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  29.67 
 
 		 653 aa  135  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  27.09 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.16 
 
 		 674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.49 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 		 699 aa  127  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  34.59 
 
 		 674 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 665 aa  124  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.8 
 
 		 622 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.8 
 
 		 622 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.8 
 
 		 622 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.1 
 
 		 673 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  29.91 
 
 		 626 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  40.08 
 
 		 612 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  42.68 
 
 		 657 aa  113  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  38.71 
 
 		 329 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  32.13 
 
 		 618 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  38.33 
 
 		 689 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  43.59 
 
 		 738 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  43.59 
 
 		 730 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  38.34 
 
 		 696 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  47.06 
 
 		 558 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  47.06 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  39.9 
 
 		 265 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.42 
 
 		 616 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  45.98 
 
 		 713 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  40.2 
 
 		 719 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  45.16 
 
 		 776 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  43.2 
 
 		 680 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  42.61 
 
 		 607 aa  86.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.87 
 
 		 788 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  44.1 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.94 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  39.53 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  23.73 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  40.76 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.59 
 
 		 600 aa  80.1  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  40.76 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  31.02 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  32.43 
 
 		 333 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  44.53 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  28.99 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.16 
 
 		 351 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>