More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0209 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.87 
 
 		 727 aa  903    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  90.75 
 
 		 703 aa  1147    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 		 701 aa  1393    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.5 
 
 		 725 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  63.5 
 
 		 677 aa  816    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  56.67 
 
 		 671 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  65.41 
 
 		 721 aa  874    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  51.01 
 
 		 683 aa  656    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  74.93 
 
 		 690 aa  986    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  67.17 
 
 		 711 aa  906    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  89.3 
 
 		 717 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  88.96 
 
 		 717 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  87.54 
 
 		 714 aa  512  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  69.7 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  69.97 
 
 		 673 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  69.97 
 
 		 673 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  69.52 
 
 		 672 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  67.67 
 
 		 668 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  70.37 
 
 		 664 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.14 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.75 
 
 		 618 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.14 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.82 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  35.06 
 
 		 669 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.97 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.08 
 
 		 619 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.41 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.66 
 
 		 619 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  35.34 
 
 		 680 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  35.66 
 
 		 650 aa  340  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  37.38 
 
 		 660 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  55.1 
 
 		 800 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  33.99 
 
 		 696 aa  327  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  35.45 
 
 		 653 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  36.72 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.46 
 
 		 608 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  34.51 
 
 		 614 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.88 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  34.14 
 
 		 689 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  34.67 
 
 		 670 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.82 
 
 		 665 aa  286  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.71 
 
 		 705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  35.01 
 
 		 657 aa  272  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  33.61 
 
 		 617 aa  270  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  35.41 
 
 		 719 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.84 
 
 		 619 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.78 
 
 		 622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.78 
 
 		 622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.78 
 
 		 622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  36.01 
 
 		 618 aa  250  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.19 
 
 		 673 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 699 aa  244  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  40.94 
 
 		 637 aa  237  6e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  40.62 
 
 		 637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.41 
 
 		 612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  26.25 
 
 		 643 aa  234  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  38.72 
 
 		 346 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.86 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  37.91 
 
 		 356 aa  228  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.31 
 
 		 357 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.38 
 
 		 364 aa  225  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  33.06 
 
 		 605 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  37.61 
 
 		 347 aa  225  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.34 
 
 		 382 aa  224  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  38.41 
 
 		 364 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.69 
 
 		 374 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.58 
 
 		 384 aa  223  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.31 
 
 		 369 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.77 
 
 		 340 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  39.69 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  37.98 
 
 		 351 aa  223  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  38.75 
 
 		 346 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.56 
 
 		 337 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  38.17 
 
 		 345 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.58 
 
 		 383 aa  221  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.96 
 
 		 386 aa  220  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.81 
 
 		 373 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.37 
 
 		 341 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.04 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.99 
 
 		 340 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  32.73 
 
 		 580 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  40.37 
 
 		 372 aa  219  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.62 
 
 		 337 aa  219  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.62 
 
 		 337 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.35 
 
 		 340 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.88 
 
 		 362 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.88 
 
 		 362 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.81 
 
 		 370 aa  217  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  36.96 
 
 		 364 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.46 
 
 		 358 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.46 
 
 		 358 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.39 
 
 		 386 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.99 
 
 		 340 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  28.18 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  46.5 
 
 		 654 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  40.81 
 
 		 334 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.38 
 
 		 362 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.62 
 
 		 391 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  40 
 
 		 362 aa  214  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  40.81 
 
 		 334 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>