More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1821 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1821  putative signal transduction histidine kinase sensor  100 
 
 		 703 aa  1440    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.982288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2104  histidine kinase  91.31 
 
 		 700 aa  1278    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.16 
 
 		 602 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 410 aa  128  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  38.31 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  39.09 
 
 		 398 aa  117  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  39.34 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  31.51 
 
 		 415 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  36.92 
 
 		 408 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  28.63 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 413 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 414 aa  101  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 431 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 440 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 357 aa  93.2  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 574 aa  90.1  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 440 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  28.51 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  26.75 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  28.36 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  26.27 
 
 		 597 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  28.63 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  27.16 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 589 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  40 
 
 		 496 aa  80.5  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 575 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  26.75 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  28.34 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  29.67 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  28.51 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  24.43 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 496 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  31.72 
 
 		 465 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  25.73 
 
 		 452 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  29.81 
 
 		 395 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  32.97 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  32.89 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.53 
 
 		 1162 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  25.11 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.65 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  30.57 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  28.44 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.48 
 
 		 452 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.85 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 454 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.85 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  33.58 
 
 		 453 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  33.58 
 
 		 453 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  25 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.82 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  27.8 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.85 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  23.18 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  30.92 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  28.3 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  27.67 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  24.88 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 442 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  25.91 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  28.27 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  28.78 
 
 		 523 aa  72  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.73 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  29.01 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  32.85 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  30.96 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  32.85 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  30.96 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>