More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0274 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
413 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.87 
 
 
426 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  70.53 
 
 
408 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.22 
 
 
431 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  68.86 
 
 
408 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  64.29 
 
 
398 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 
427 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.63 
 
 
414 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.08 
 
 
440 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  54.68 
 
 
431 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  56.75 
 
 
496 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  50.53 
 
 
415 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 
414 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
469 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  35.18 
 
 
461 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
467 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
536 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
428 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
550 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
449 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
449 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  35.94 
 
 
457 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  36.98 
 
 
449 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.89 
 
 
428 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  36.71 
 
 
428 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.02 
 
 
471 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  34.45 
 
 
449 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  35.03 
 
 
436 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  32.11 
 
 
453 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  35.03 
 
 
433 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
456 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
456 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  34.35 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.78 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  32.75 
 
 
432 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
420 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
536 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
453 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
454 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
430 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
445 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  34.01 
 
 
433 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  33.78 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.52 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.78 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  34.04 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.99 
 
 
433 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  34.01 
 
 
433 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  32.99 
 
 
433 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  32.99 
 
 
433 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  32.99 
 
 
433 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
458 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  32.97 
 
 
439 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
429 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  33.33 
 
 
433 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  33.33 
 
 
433 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  33.33 
 
 
433 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  32.82 
 
 
450 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  29.39 
 
 
422 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
427 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  36.46 
 
 
469 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  33.1 
 
 
464 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  33.33 
 
 
433 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
449 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.44 
 
 
431 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
446 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  36.67 
 
 
476 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  33.66 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  34.55 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  27.11 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
449 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
458 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
563 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  34.38 
 
 
538 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
535 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  32.46 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  35 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  32.99 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  35 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  32.13 
 
 
472 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  35 
 
 
442 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
490 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
535 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.08 
 
 
446 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  34.04 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  34.04 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  33.57 
 
 
434 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  34.03 
 
 
452 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>