More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2642 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  100 
 
 		 496 aa  955    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  52.43 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  51.34 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  55.13 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.81 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  56.34 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 		 414 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.63 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  46.87 
 
 		 415 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.16 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  40.85 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 461 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 563 aa  156  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.43 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  33.13 
 
 		 561 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  40.43 
 
 		 442 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  40.43 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  37.42 
 
 		 446 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  40.43 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  33.65 
 
 		 561 aa  148  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 446 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 427 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 428 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  37.81 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.65 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  32.42 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2801  sensor protein RstB, putative  32.79 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.64 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  34.3 
 
 		 428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  34.19 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  34.19 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.53 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  36.77 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  34.19 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  34.19 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  34.19 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  33.67 
 
 		 457 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 550 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  34.27 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  33.23 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  33.33 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.54 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  32.03 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  33.75 
 
 		 445 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  33.87 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  33.87 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  33.87 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  33.87 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.26 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 546 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  31.35 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  36.81 
 
 		 538 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  36.84 
 
 		 428 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.46 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  33.02 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.11 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  36.82 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  31.79 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>