200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0837 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  848    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  85.27 
 
 		 404 aa  714    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  55.28 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  39.08 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  40.06 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  38.73 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  39.62 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  39.75 
 
 		 312 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  38.8 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  38.49 
 
 		 312 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  38.49 
 
 		 312 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  37.54 
 
 		 312 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  37.62 
 
 		 312 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  37.62 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  38.13 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  35.67 
 
 		 318 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  37.19 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  36.82 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  36.82 
 
 		 304 aa  193  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 304 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  35.35 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  35.02 
 
 		 304 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  35.35 
 
 		 304 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  35.02 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  35.02 
 
 		 304 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  33.97 
 
 		 304 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  34.08 
 
 		 308 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  34.8 
 
 		 308 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.48 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  33.54 
 
 		 308 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.44 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.01 
 
 		 314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.74 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.25 
 
 		 316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.03 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.69 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.21 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.99 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.51 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.33 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.58 
 
 		 319 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.56 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.33 
 
 		 323 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2285  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.29 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.346032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.92 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.21 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.2 
 
 		 348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.29 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.01 
 
 		 339 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.53 
 
 		 316 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.16 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  31.33 
 
 		 318 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.82 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.16 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.34 
 
 		 313 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.27 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  28.08 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.66 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.14 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  28.08 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.85 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  30.29 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.29 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.15 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.5 
 
 		 301 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.12 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  27.48 
 
 		 306 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  26.92 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.14 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.7 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.21 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  26.54 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  26.54 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  31.94 
 
 		 306 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  26.49 
 
 		 293 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.68 
 
 		 310 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  25.91 
 
 		 293 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  28.95 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.76 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.59 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>