213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1956 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
319 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  67.01 
 
 
301 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  50.16 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  52.07 
 
 
292 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  52.36 
 
 
325 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.54 
 
 
306 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  38.61 
 
 
306 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  38.61 
 
 
306 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  37.95 
 
 
306 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  38.28 
 
 
306 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.53 
 
 
309 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  37.95 
 
 
306 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  38.28 
 
 
306 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  38.28 
 
 
306 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  38.28 
 
 
306 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  37.95 
 
 
306 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.61 
 
 
312 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.91 
 
 
318 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.09 
 
 
305 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.27 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  42.24 
 
 
311 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.93 
 
 
297 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.69 
 
 
310 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  44.22 
 
 
310 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.65 
 
 
344 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  37.17 
 
 
361 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.84 
 
 
321 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  45.19 
 
 
309 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.51 
 
 
321 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  45.95 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.57 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.42 
 
 
339 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.44 
 
 
313 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.85 
 
 
300 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.91 
 
 
305 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.05 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.14 
 
 
363 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  39.81 
 
 
333 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  41.09 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.07 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  30.24 
 
 
293 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.79 
 
 
304 aa  162  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.21 
 
 
311 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.89 
 
 
305 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  30.24 
 
 
293 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.59 
 
 
312 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.65 
 
 
339 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.44 
 
 
299 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.89 
 
 
316 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.93 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.03 
 
 
348 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  40.66 
 
 
312 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.39 
 
 
301 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  34.89 
 
 
297 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.03 
 
 
348 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.44 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.66 
 
 
312 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.59 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.11 
 
 
299 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.31 
 
 
315 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.26 
 
 
312 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.8 
 
 
296 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.99 
 
 
297 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.78 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.99 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.62 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  29.59 
 
 
292 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.98 
 
 
310 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.59 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.76 
 
 
299 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.08 
 
 
316 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.81 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.54 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.87 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.21 
 
 
299 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.53 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  38.22 
 
 
318 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.84 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  37.54 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  37.37 
 
 
313 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.13 
 
 
303 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.68 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  30.25 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  35.29 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.37 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  33.89 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  35.06 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.22 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68670  putative carboxypeptidase  36.9 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  35.02 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  34.56 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  34.56 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  38.71 
 
 
307 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  36.13 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  34.66 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  36.13 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  36.13 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  36.13 
 
 
313 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  34.11 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>