202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4808 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 
359 aa  727    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  74.18 
 
 
328 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  73.89 
 
 
328 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  74.33 
 
 
300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  68.24 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  68.87 
 
 
316 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  64.69 
 
 
319 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2285  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  63.22 
 
 
351 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.346032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  65.5 
 
 
321 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.53 
 
 
308 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  51.13 
 
 
319 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  44.06 
 
 
314 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  44.22 
 
 
306 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  43.89 
 
 
308 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  42.24 
 
 
308 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  43.89 
 
 
308 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 
308 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  42.35 
 
 
318 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  40.07 
 
 
308 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  39.6 
 
 
313 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.61 
 
 
314 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  38.28 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  38.74 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  38.61 
 
 
304 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  37.95 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
312 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  39.07 
 
 
304 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  39.07 
 
 
304 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  38.74 
 
 
304 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  38.67 
 
 
312 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  38.74 
 
 
304 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  39.33 
 
 
304 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  38.85 
 
 
312 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  38.33 
 
 
312 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  37.84 
 
 
304 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  38.03 
 
 
304 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  37.5 
 
 
304 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  37.58 
 
 
304 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  36.01 
 
 
404 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.78 
 
 
423 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  34.03 
 
 
414 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.59 
 
 
322 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.2 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.35 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.45 
 
 
312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.51 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.82 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  31.39 
 
 
306 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  31.39 
 
 
306 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.19 
 
 
316 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  30.74 
 
 
306 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  31.07 
 
 
306 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.74 
 
 
306 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.15 
 
 
305 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.33 
 
 
363 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  32.18 
 
 
318 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.79 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.39 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.62 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  27.72 
 
 
297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.67 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.39 
 
 
301 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.67 
 
 
357 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  34.3 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.07 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.77 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.1 
 
 
299 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.69 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3904  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.67 
 
 
288 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.8 
 
 
321 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.99 
 
 
305 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.58 
 
 
315 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.67 
 
 
288 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.59 
 
 
305 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.55 
 
 
319 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.42 
 
 
339 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.15 
 
 
321 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.43 
 
 
297 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.43 
 
 
297 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.56 
 
 
296 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.45 
 
 
296 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.52 
 
 
316 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>