205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1749 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 		 319 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  65.99 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  50 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.62 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.63 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.31 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  49.37 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  50.95 
 
 		 316 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.01 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2285  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  47.4 
 
 		 351 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.346032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.56 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  47.96 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  44.04 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  44.04 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  46.42 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  43 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  43.81 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.86 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  42.47 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  41.16 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  42.23 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  41.96 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  41.95 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  41.96 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  41.96 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  41.96 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  40.8 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  39.86 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  41.14 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  41.61 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  40.79 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  40.79 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  41.2 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  41.39 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  40.85 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  40.13 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  39.6 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  40.49 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  41.4 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  37.93 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.64 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  34.58 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.83 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 		 404 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.89 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.24 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.68 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.32 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.61 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.72 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  29.19 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  29.86 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  29.82 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.11 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.45 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.48 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.89 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.18 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  33.58 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.15 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.02 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  33.55 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.67 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.84 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  28.86 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  28.19 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.71 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.85 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  28.19 
 
 		 306 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.71 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.94 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  27.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  27.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  27.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.97 
 
 		 304 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.52 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.98 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.46 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.2 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.77 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.71 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  26.48 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.91 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.85 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>