216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4852 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  93.27 
 
 		 312 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  92.31 
 
 		 312 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  81.67 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  58.63 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  44.88 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.21 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.53 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  36.57 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.95 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  36.25 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  37.38 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  36.25 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.54 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  36.81 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.1 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  36.81 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  35.6 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  37.05 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  37.05 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.6 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.73 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.97 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.08 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.08 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.31 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  33.57 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.73 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  33.57 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.31 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.13 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  36.39 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.13 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.01 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.82 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.95 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.24 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  39.68 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  42.91 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.22 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.26 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.91 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.82 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.58 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.91 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.37 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.47 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  32.68 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.8 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.98 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.78 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.66 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.11 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.26 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.47 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.24 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.23 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.39 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3904  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.12 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.25 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.46 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.65 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.84 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.66 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.56 
 
 		 304 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  32.68 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.3 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.55 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.16 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  35 
 
 		 298 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  29.32 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.13 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.05 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.7 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.95 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  35.21 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.01 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  31.7 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  35.71 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  33.45 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.9 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  35.34 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.3 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  35.58 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  28.62 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  32.99 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  27.99 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.78 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  28.3 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.62 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  32.64 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.31 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  32.64 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  32.64 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  32.64 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>