215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0019 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 
316 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  64.76 
 
 
322 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  64.56 
 
 
323 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  62.74 
 
 
320 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  57.55 
 
 
318 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  55 
 
 
314 aa  342  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  55.67 
 
 
316 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.82 
 
 
318 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.48 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.53 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.93 
 
 
312 aa  195  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.09 
 
 
316 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.37 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 
361 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.59 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.53 
 
 
315 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  38.13 
 
 
308 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.91 
 
 
363 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  37.62 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  36.49 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  37.71 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  36.36 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.06 
 
 
341 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  35 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  34.75 
 
 
308 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  36.16 
 
 
308 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  39 
 
 
312 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.67 
 
 
312 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  36.84 
 
 
312 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  34.26 
 
 
293 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.13 
 
 
312 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  35.16 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.12 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  36.21 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  34.26 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.9 
 
 
305 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  36.51 
 
 
312 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  36.51 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  36.51 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  35.67 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  34.84 
 
 
313 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.45 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  34.74 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.81 
 
 
311 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  34.71 
 
 
312 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.33 
 
 
306 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  34.23 
 
 
306 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
348 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
348 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 
304 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.55 
 
 
339 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  34.23 
 
 
306 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.97 
 
 
309 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  34.23 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  34.45 
 
 
304 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  34.46 
 
 
304 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  34.46 
 
 
304 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.17 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  34.49 
 
 
304 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.18 
 
 
297 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  34.46 
 
 
304 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.59 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  34.12 
 
 
304 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  34.02 
 
 
304 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  34.84 
 
 
304 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  33.22 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.42 
 
 
329 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  33.11 
 
 
304 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.78 
 
 
310 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.97 
 
 
292 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  34.36 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  34.36 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  34.36 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  34.02 
 
 
306 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  34.02 
 
 
306 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  33.11 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.87 
 
 
314 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.29 
 
 
314 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.45 
 
 
299 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.56 
 
 
344 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.29 
 
 
316 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.63 
 
 
288 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.72 
 
 
338 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  29.48 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  30.43 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.43 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  30.56 
 
 
414 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  34.74 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.33 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>