207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1942 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  99.34 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  99.34 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  99.34 
 
 		 304 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  98.68 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  79.93 
 
 		 304 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  79.28 
 
 		 304 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  78.62 
 
 		 304 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  78.95 
 
 		 304 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  68.32 
 
 		 304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  53.97 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  53.31 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  51.67 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  51.99 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  50.17 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  50.17 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  49.83 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  49.83 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  50.33 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  50.66 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  50.99 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  50.66 
 
 		 313 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  49.33 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  49.16 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  49.01 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  47.74 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  47.25 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  47.1 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  43.23 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.31 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.44 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.32 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.75 
 
 		 321 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.8 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.32 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.8 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.74 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.8 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.4 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.85 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.61 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  35.02 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 		 404 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.68 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.29 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.23 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.27 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.12 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  32.89 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.62 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.77 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.58 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.58 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.31 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.31 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.37 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  30.54 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2285  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  50.43 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.346032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  31.31 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.34 
 
 		 339 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.45 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  28.68 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.1 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.35 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.81 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.32 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  28.3 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.76 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.95 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.03 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.53 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.59 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.93 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.6 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.86 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.23 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.82 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.7 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  32.7 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.29 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>