212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3393 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
344 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  49.68 
 
 
310 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  48.01 
 
 
311 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.38 
 
 
309 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  48.52 
 
 
333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  47.06 
 
 
309 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.96 
 
 
301 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.37 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.23 
 
 
339 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.58 
 
 
325 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.26 
 
 
297 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.98 
 
 
348 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  42 
 
 
306 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.36 
 
 
292 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.13 
 
 
306 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.94 
 
 
312 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.65 
 
 
319 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  33.11 
 
 
306 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  33.11 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  32.79 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  33.11 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  33.11 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.37 
 
 
348 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.8 
 
 
306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.45 
 
 
357 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.91 
 
 
318 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.15 
 
 
306 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.73 
 
 
300 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.2 
 
 
301 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.9 
 
 
363 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.16 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  38.56 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.63 
 
 
312 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.73 
 
 
312 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.26 
 
 
312 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.64 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.68 
 
 
310 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  33.45 
 
 
300 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.49 
 
 
341 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  36.36 
 
 
298 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.67 
 
 
309 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.55 
 
 
299 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.59 
 
 
296 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
299 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.33 
 
 
305 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.17 
 
 
310 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.2 
 
 
297 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.2 
 
 
297 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.53 
 
 
299 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.56 
 
 
316 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.92 
 
 
303 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.21 
 
 
304 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.89 
 
 
339 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.95 
 
 
315 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.13 
 
 
348 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  31.8 
 
 
297 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.58 
 
 
323 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  31.76 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.46 
 
 
313 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.37 
 
 
329 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.87 
 
 
321 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.54 
 
 
321 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  38.16 
 
 
321 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.45 
 
 
296 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.01 
 
 
301 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.29 
 
 
344 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.56 
 
 
316 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.19 
 
 
288 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.34 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  33.78 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  34.32 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.23 
 
 
299 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  36.22 
 
 
317 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.63 
 
 
316 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.08 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  33.78 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.79 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.76 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.76 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  29 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  29 
 
 
293 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.49 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  31.65 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.44 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.46 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  26.69 
 
 
290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  33.99 
 
 
304 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  30.2 
 
 
308 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
304 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  33.66 
 
 
304 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  30.85 
 
 
306 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
304 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  31.27 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  26.69 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.68 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  26.26 
 
 
289 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>