203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2797 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 		 321 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2448  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  67.3 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  66.25 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  65.71 
 
 		 326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  66.45 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  65.81 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  65.29 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2285  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  59.38 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.346032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  67 
 
 		 300 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  53.31 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1749  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  52.63 
 
 		 319 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0546676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  45.95 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  43.29 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  45.52 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  43.62 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  42.76 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  42.76 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  45.97 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  42.62 
 
 		 312 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  42.42 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  45.36 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  41.95 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  41.22 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  41.41 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  40.54 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  40.27 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  44.22 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  40.2 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  42.42 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0543  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42.52 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  42.09 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  41.75 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  38.8 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  41.75 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  41.75 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.61 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  36.51 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  38.57 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  39.02 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  38.46 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.59 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  32.51 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.68 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.93 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.71 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.2 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.19 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.79 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.04 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.13 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.25 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.31 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  30.07 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  30.42 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.45 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.74 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.49 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  35.02 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.53 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.23 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.65 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.7 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.37 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.21 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.24 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.47 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.65 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.8 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.57 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  28.47 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.17 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  28.92 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  30.97 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  28.92 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.21 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.17 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  29.27 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.87 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.15 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  28.57 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  27.53 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  28.22 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.68 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  28.22 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.12 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>