216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0046 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 		 322 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  72.05 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  67.08 
 
 		 323 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  64.76 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  64.35 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  54.97 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  56.8 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.21 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.45 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.88 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.7 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.54 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.94 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.81 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  36.2 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  36.21 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  35.35 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.62 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.04 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  35.99 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  35.99 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.02 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  33.55 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  34.01 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  35.99 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.9 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  35.22 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.46 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  34.78 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.18 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.66 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  34.78 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.49 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  32.41 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  30.94 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.58 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  30.62 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  30.62 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  30.62 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.28 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  37.97 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.81 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.22 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  36.21 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  32.42 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  30.29 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  32.42 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  32.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  31.61 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  32.78 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.02 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.92 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  32.08 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  32.08 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  32.57 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  32.11 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  33 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  35.88 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.56 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  32.08 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  33.68 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  36.21 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  36.21 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.54 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  36.21 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  36.21 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  33.33 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  32.28 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  31.4 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.42 
 
 		 310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  28.44 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  30.63 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  28.31 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  28.31 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.27 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.79 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.43 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>