215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  100 
 
 
306 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  56.27 
 
 
325 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  51.89 
 
 
292 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  50.16 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  50.5 
 
 
301 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.75 
 
 
300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.82 
 
 
309 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  42 
 
 
310 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.39 
 
 
315 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42 
 
 
344 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.41 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.72 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.33 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  36.79 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  32.69 
 
 
306 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.01 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.44 
 
 
305 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  33.01 
 
 
306 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  32.04 
 
 
306 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  32.69 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  32.36 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.72 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.1 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.03 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  32.99 
 
 
300 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.54 
 
 
312 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  42.33 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.63 
 
 
357 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  37.13 
 
 
333 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.86 
 
 
313 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.91 
 
 
305 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.39 
 
 
318 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.67 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.69 
 
 
310 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.8 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.06 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.46 
 
 
321 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.77 
 
 
297 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  26.1 
 
 
293 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.8 
 
 
321 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.79 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.22 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  26.32 
 
 
293 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.97 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  38.61 
 
 
321 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.9 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.31 
 
 
296 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.85 
 
 
289 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.97 
 
 
299 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.43 
 
 
348 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39 
 
 
301 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.34 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.07 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.12 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.34 
 
 
312 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  34.49 
 
 
298 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.43 
 
 
288 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.67 
 
 
297 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.55 
 
 
348 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.26 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.98 
 
 
297 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.57 
 
 
329 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.98 
 
 
297 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.33 
 
 
296 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  27.78 
 
 
292 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.68 
 
 
301 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.2 
 
 
321 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.94 
 
 
312 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  34.85 
 
 
299 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.94 
 
 
312 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.54 
 
 
299 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.28 
 
 
316 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.49 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.29 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.19 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.87 
 
 
311 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  26.51 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.2 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  25.08 
 
 
290 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.46 
 
 
315 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  32.89 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  30.54 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  26.1 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  26.17 
 
 
289 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.05 
 
 
314 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.75 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  36.1 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  31.76 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  32.66 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.124574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>