206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4524 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
309 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  58.12 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  56.41 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.78 
 
 
325 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  47.1 
 
 
292 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  44.82 
 
 
306 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.53 
 
 
319 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.23 
 
 
301 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43 
 
 
300 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.02 
 
 
312 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.67 
 
 
311 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.4 
 
 
310 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.98 
 
 
309 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  40 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.42 
 
 
357 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.33 
 
 
309 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.67 
 
 
344 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.36 
 
 
305 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.48 
 
 
363 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  38.59 
 
 
333 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.19 
 
 
318 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.37 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.44 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.1 
 
 
306 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.13 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.46 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  31.79 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.26 
 
 
305 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.87 
 
 
299 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.91 
 
 
348 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 
297 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.94 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.37 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  31.46 
 
 
306 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  31.46 
 
 
306 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  31.13 
 
 
306 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  31.13 
 
 
306 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.79 
 
 
306 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.18 
 
 
304 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  30.79 
 
 
306 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.36 
 
 
329 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  39.36 
 
 
312 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.36 
 
 
312 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.55 
 
 
312 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.84 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 
361 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.66 
 
 
301 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  39.93 
 
 
321 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.2 
 
 
321 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.71 
 
 
297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.6 
 
 
297 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.33 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.71 
 
 
312 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.39 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.2 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  35.33 
 
 
298 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.92 
 
 
299 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.69 
 
 
296 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  27.59 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.43 
 
 
285 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  34.86 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  27.59 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.51 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.66 
 
 
320 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.88 
 
 
315 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.92 
 
 
299 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.29 
 
 
323 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.26 
 
 
289 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.95 
 
 
348 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.6 
 
 
288 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  26.96 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.34 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.06 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.24 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.77 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.37 
 
 
311 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  33.44 
 
 
317 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.73 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  28.29 
 
 
318 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1015  hypothetical protein  26.26 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.654052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.2 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.08 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.23 
 
 
303 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3904  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.77 
 
 
288 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  29.02 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  35.39 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  29.02 
 
 
291 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.87 
 
 
301 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.67 
 
 
297 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  25.85 
 
 
292 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  32.62 
 
 
299 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  30.69 
 
 
308 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  32.39 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.88 
 
 
321 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.97 
 
 
344 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  32.17 
 
 
318 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.6 
 
 
298 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  31.91 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0537897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>