214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4459 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  47.33 
 
 
299 aa  301  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  44.44 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.3 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.34 
 
 
348 aa  255  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.17 
 
 
339 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.48 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.36 
 
 
303 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.82 
 
 
303 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.72 
 
 
344 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  34.15 
 
 
292 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.77 
 
 
306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  31.1 
 
 
306 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.7 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.46 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  30.1 
 
 
306 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  30.1 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  29.77 
 
 
306 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  30.1 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  29.43 
 
 
306 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  29.77 
 
 
306 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  32.31 
 
 
293 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  29.43 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.42 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  32 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.25 
 
 
312 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.01 
 
 
344 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.53 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.14 
 
 
305 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.83 
 
 
312 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.84 
 
 
310 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.03 
 
 
309 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.39 
 
 
301 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.92 
 
 
312 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.93 
 
 
316 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.92 
 
 
312 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
361 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.96 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.06 
 
 
348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.51 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.3 
 
 
363 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.51 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.85 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  29.29 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.14 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.06 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.03 
 
 
357 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  28.62 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.37 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.12 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  29.8 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.27 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  27.67 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  29.33 
 
 
333 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.62 
 
 
325 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  27.68 
 
 
306 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68670  putative carboxypeptidase  28.14 
 
 
307 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.56 
 
 
329 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.1 
 
 
297 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  28.08 
 
 
307 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.97 
 
 
319 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.19 
 
 
321 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27 
 
 
321 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.24 
 
 
313 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.28 
 
 
305 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  27.95 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.55 
 
 
315 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.32 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.52 
 
 
292 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.8 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.79 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.95 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3904  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.66 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.46 
 
 
341 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.04 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.62 
 
 
285 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.4 
 
 
339 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.87 
 
 
309 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.61 
 
 
299 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.31 
 
 
288 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.54 
 
 
315 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.76 
 
 
296 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  28.91 
 
 
317 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2777  LD-carboxypeptidase family protein  29.01 
 
 
289 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.57 
 
 
328 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0524355 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  27.49 
 
 
299 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.68 
 
 
322 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.52 
 
 
323 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.95 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.07 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.57 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  28.33 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1015  hypothetical protein  28.03 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.654052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  27.61 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.23 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  26.48 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>