216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3212 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 		 325 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  56.27 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  50.84 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  49.01 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  52.36 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.43 
 
 		 292 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.78 
 
 		 309 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  43.23 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.28 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.59 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.07 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.58 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.76 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.47 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.33 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.7 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  45.57 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  34.7 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.68 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.86 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.23 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  33.44 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.33 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  42.3 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.21 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  33.33 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.62 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  33.01 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  32.04 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  33.12 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.66 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.07 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.39 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.46 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.16 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  43.71 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.04 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.19 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.71 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.79 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.68 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.75 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.61 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.8 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.73 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  27.18 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  40.33 
 
 		 312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.33 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.46 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.5 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.76 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  26.71 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.62 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.01 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.44 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  35.83 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  31.49 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.69 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.92 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.92 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.45 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  31.08 
 
 		 300 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.17 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.7 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  31.86 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.63 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.23 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.82 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  36.61 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  26.8 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68670  putative carboxypeptidase  36.27 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.11 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.34 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.78 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  29.04 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.62 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  33 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.46 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  34.1 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  28.43 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.99 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  28.48 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.28 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.13 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  30.03 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  34.88 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  36.25 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  29.7 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  26.06 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.17 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0524355 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  35.35 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  32.67 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>