211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6400 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 		 297 aa  584  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.15 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.88 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.73 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.6 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.26 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  42.23 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  39.73 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.33 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.09 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.89 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.79 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.1 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.79 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.76 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.01 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.08 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  29.45 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.66 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  37.07 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  33.67 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.58 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  29.45 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  35.56 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.08 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.56 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.44 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.7 
 
 		 348 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.03 
 
 		 348 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.45 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  30.42 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  29.11 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.44 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.45 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.08 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  28.77 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  27.74 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.84 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  28.08 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.28 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.51 
 
 		 344 aa  132  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.79 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 361 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.76 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  33.67 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.67 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.59 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.22 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.33 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.62 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  31.29 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  27.59 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  32.54 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.1 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.67 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.9 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.37 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.72 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  30.61 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.8 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.79 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.46 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.21 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.88 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.06 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  27.7 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17261  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.64 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.71 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.81 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  30.39 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.78 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.21 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.67 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.54 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.21 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.31 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  29.7 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  28.62 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.8 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.2 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  28.96 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  29.15 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.99 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.54 
 
 		 331 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.71 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  25.72 
 
 		 328 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  25.89 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  30 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  26.05 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.54 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  26.05 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  26.54 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.73 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>