187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1741 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  68.24 
 
 
294 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  65.65 
 
 
299 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  51.88 
 
 
291 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  51.88 
 
 
291 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04561  putative carboxypeptidase  56.12 
 
 
300 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  43.49 
 
 
289 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  42.12 
 
 
289 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  41.69 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  41.64 
 
 
290 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.59 
 
 
304 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  44.55 
 
 
299 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  46.36 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.81 
 
 
296 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.07 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.03 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  44.75 
 
 
298 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.12 
 
 
296 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  41.39 
 
 
317 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  40.6 
 
 
321 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17261  hypothetical protein  37.79 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.53 
 
 
339 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.58 
 
 
321 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.29 
 
 
313 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.25 
 
 
321 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.19 
 
 
311 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  38.61 
 
 
321 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.66 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.91 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  35.76 
 
 
312 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.55 
 
 
311 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.79 
 
 
310 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.55 
 
 
310 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  33.12 
 
 
306 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  32.69 
 
 
306 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  32.69 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.53 
 
 
363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.33 
 
 
309 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  32.79 
 
 
306 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.59 
 
 
357 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  31.89 
 
 
297 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  32.47 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.57 
 
 
305 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.97 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.95 
 
 
315 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.14 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.64 
 
 
341 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.83 
 
 
319 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.19 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.19 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.28 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.32 
 
 
297 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.7 
 
 
339 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.33 
 
 
333 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  32.9 
 
 
361 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.07 
 
 
299 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.81 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  29.69 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.75 
 
 
305 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  33.87 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.8 
 
 
299 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.13 
 
 
423 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.28 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.25 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.06 
 
 
316 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  30.68 
 
 
292 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.8 
 
 
348 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
303 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.81 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.03 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.72 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  30.66 
 
 
308 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.22 
 
 
320 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.09 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  27.72 
 
 
293 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  28.29 
 
 
293 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.01 
 
 
323 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  29.62 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.22 
 
 
292 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.24 
 
 
344 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.46 
 
 
314 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.23 
 
 
325 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  31.82 
 
 
304 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.18 
 
 
301 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  30.52 
 
 
318 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0859  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
404 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.16 
 
 
329 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.58 
 
 
322 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.15 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.8 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  34.72 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  27.99 
 
 
414 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.58 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.81 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  32.58 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  31.72 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>